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基因组测序质量控制

原创版权 0 关键字:基因组测序质量控制,第三方检测机构,中析研究所 相关: 发布时间: 2025-08-19 10:34:07

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因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).

检测项目

准确性检测:

  • 碱基调用错误率:错误率≤0.1%(参照ISO20395:2019)
  • Q30评分:评分≥90%(参照ENISO20395:2020)
  • 插入缺失率:插入错误率≤0.05%、缺失错误率≤0.05%(参照GB/T30988-2014)
覆盖度检测:
  • 平均覆盖深度:深度≥30x(参照ISO20395:2019)
  • 覆盖均一性:变异系数≤0.2(参照ENISO20395:2020)
  • 目标区域覆盖率:覆盖率≥98%(参照GB/T30988-2014)
错误率检测:
  • 系统错误率:系统错误率≤0.02%(参照ISO20395:2019)
  • 随机错误率:随机错误率≤0.03%(参照ENISO20395:2020)
  • 错误累积指数:指数≤1.05(参照GB/T30988-2014)
GC偏差检测:
  • GC含量偏差:偏差±5%(参照ISO20395:2019)
  • GC相关性:相关系数≥0.95(参照ENISO20395:2020)
  • GC富集度:富集度≤1.1(参照GB/T30988-2014)
接头污染检测:
  • 接头序列占比:占比≤0.5%(参照ISO20395:2019)
  • 引物残留量:残留量≤0.1%(参照ENISO20395:2020)
  • 非特异性结合率:结合率≤0.2%(参照GB/T30988-2014)
重复序列检测:
  • PCR重复率:重复率≤10%(参照ISO20395:2019)
  • 克隆重复指数:指数≤1.05(参照ENISO20395:2020)
  • 重复序列占比:占比≤15%(参照GB/T30988-2014)
变异检测准确性:
  • SNP召回率:召回率≥99%(参照ISO20395:2019)
  • SNP精确度:精确度≥99%(参照ENISO20395:2020)
  • 结构变异误差:误差率≤0.5%(参照GB/T30988-2014)
序列长度分布:
  • 平均读长:读长150bp±5bp(参照ISO20395:2019)
  • 读长标准差:标准差≤10bp(参照ENISO20395:2020)
  • 短读片段率:片段率≤5%(参照GB/T30988-2014)
质量评分分布:
  • 平均质量评分:评分≥30(参照ISO20395:2019)
  • 低质量碱基占比:占比≤2%(参照ENISO20395:2020)
  • 质量衰减率:衰减率≤0.1%/bp(参照GB/T30988-2014)
一致性检测:
  • 样本间一致性:相关系数≥0.99(参照ISO20395:2019)
  • 批次间变异:变异系数≤0.1(参照ENISO20395:2020)
  • 技术重复一致性:一致性≥98%(参照GB/T30988-2014)

检测范围

1.人类全基因组测序:涵盖单核苷酸多态性(SNP)和结构变异分析,重点检测测序深度均一性和变异位点准确性

2.外显子组测序:针对编码区域,侧重目标捕获效率、覆盖深度和剪接变异检测

3.RNA测序:包括转录本表达量分析,重点检测基因表达准确性和拼接事件可靠性

4.微生物宏基因组测序:涉及环境样本,关注物种组成准确性、污染控制和低丰度物种检测

5.植物基因组测序:涵盖作物育种,强调重复序列处理、组装质量和杂合性评估

6.癌症基因组测序:针对肿瘤样本,重点检测低频变异敏感性、背景噪声和拷贝数变异

7.单细胞测序:包括细胞异质性分析,侧重技术偏差控制、细胞捕获效率和表达一致性

8.表观基因组测序:如ChIP-seq,关注峰调用准确性、背景噪声和修饰位点检测

9.环境DNA测序:涉及土壤或水体,重点检测稀有物种检测限、污染排除和多样性指数

10.古DNA测序:针对降解样本,强调损伤修复验证、污染控制和序列真实性

检测方法

国际标准:

  • ISO20395:2019生物技术–下一代测序质量指标和测试方法
  • ENISO20395:2020生物技术–测序数据质量评估指南
  • ISO21748:2017测量不确定度指南在基因测序中的应用
国家标准:
  • GB/T30988-2014生物技术高通量测序数据质量控制规范
  • GB/T35538-2017基因组测序数据准确性评价方法
  • GB/T37872-2019生物信息学分析中测序数据质量要求
方法差异说明:ISO标准侧重错误率全局计算,GB/T标准强化参数阈值本地化;EN标准强调覆盖均一性算法,GB/T引入特定样本类型调整;ISO21748规定不确定度模型,GB/T37872整合变异检测验证步骤

检测设备

1.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量最高20Tb/run)

2.长读长测序仪:PacBioSequelII(读长>10kb)

3.纳米孔测序仪:OxfordNanoporeMinION(实时测序速度400bp/s)

4.质谱仪:ThermoFisherQExactive(质量精度<2ppm)

5.生物分析仪:Agilent2100(片段大小分析范围35bp-7500bp)

6.qPCR仪:RocheLightCycler480(检测灵敏度0.01拷贝/μL)

7.自动化工作站:TecanFreedomEVO(样本处理通量96孔/批次)

8.计算服务器:DellPowerEdgeR940(内存3TB,CPU核心64个)

9.存储系统:EMCIsilonF800(容量1.5PB,IOPS>100k)

10.荧光定量仪:Bio-RadCFX96(动态范围10^7)

11.电泳系统:LabChipGXTouch(分辨率1bp)

12.离心机:Eppendorf5430(转速15000rpm)

13.温控系统:ThermoScientificArctic(温度范围-10°C至100°C)

14.光学显微镜:OlympusBX53(放大倍数1000x)

15.数据采集器:Keysight34465A(采样率100kS/s)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

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中析研究所配方实验室提供科学的产品成分检测服务,主要包括产品或样品的组成成分、元素或原料等的成分含量的检测和分析。我们拥有先进的实验室设备和技术人员,能够根据客户的需求和要求,为其提供个性化的检测方案。我们的专家团队通过精密仪器和标准检测方法,对样品进行全面深入的检测分析,以确保分析结果的准确性和可靠性。
中析研究所农副产品实验室提供多样化的服务范围,涵盖了蔬菜、瓜果、水产品、禽蛋、肉类及其制品、粮油及其制品、豆制品、熟食、调味品等农副产品的检测分析服务。我们拥有一流的实验室设备和强大的技术人员,可为客户提供全面的农副产品检测服务,包括生产环节中的农药残留、重金属、微生物污染及食品添加剂等问题的检测和分析。
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  • 我们承诺

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