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干旱胁迫下种子基因表达谱检测

原创版权 关键字:干旱胁迫下种子基因表达谱测试范围,干旱胁迫下种子基因表达谱测试仪器,干旱胁迫下种子基因表达谱测试方法 相关: 发布时间: 2025-07-26 11:19:34

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因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).

检测项目

胁迫响应基因表达:

  • 干旱响应基因转录水平:FPKM值变化倍数≥1.5(参照ISO20387)
  • 热激蛋白表达量:HSP70相对定量≥2倍增量
  • 抗氧化酶基因表达:SOD活性单位U/mg蛋白
信号传导通路分析:
  • ABA信号通路基因:NCED3表达水平(相对对照)
  • ROS清除机制:CAT酶活性变化百分比
  • 钙信号传导:Ca²⁺浓度波动检测(单位μM)
转录组差异分析:
  • 差异表达基因数量:上调基因≥200个(p值<0.05)
  • GO功能富集:生物过程富集度(FDR<0.01)
  • KEGG通路分析:代谢通路显著性评分
代谢组关联检测:
  • 脯氨酸积累量:μmol/g鲜重(参照GB/T30984)
  • 可溶性糖含量:mg/g干重变化率
  • 脂质过氧化程度:MDA浓度检测值
表型参数量化:
  • 萌发率下降幅度:相对对照≤70%
  • 根系伸长抑制率:百分比偏差±5%
  • 叶片萎蔫指数:等级评分1-5级
表观遗传调控:
  • DNA甲基化水平:5mC%变化(Bisulfite测序)
  • 组蛋白修饰检测:H3K9me2丰度相对值
  • 非编码RNA表达:miRNA靶向验证率
蛋白互作网络:
  • 酵母双杂交互作:阳性克隆筛选标准
  • Co-IP复合体检测:蛋白结合亲和力
  • 磷酸化位点分析:磷酸化水平比率
细胞结构变化:
  • 液泡膜完整性:透射电镜观察评分
  • 细胞壁成分:纤维素含量百分比
  • 叶绿体损伤:类囊体结构参数
激素水平检测:
  • ABA含量测定:ng/g鲜重(HPLC标准)
  • 乙烯释放速率:ppm变化量
  • JA信号分子浓度:定量阈值
环境模拟参数:
  • 土壤含水量控制:15%体积含水量(VWC)
  • 光照强度调节:PAR200μmol/m²/s
  • 温度波动范围:±2°C偏差

检测范围

1.玉米种子:涵盖Zeamays品种,重点检测萌发期干旱响应基因表达动态与萌发率关联

2.小麦种子:覆盖Triticumaestivum品系,侧重幼苗期水分胁迫信号传导通路和根系生长抑制分析

3.水稻种子:针对Oryzasativa样本,检测灌浆期干旱耐受基因表达谱及籽粒产量影响

4.大豆种子:包括Glycinemax类型,重点分析根瘤共生相关胁迫基因调控网络

5.棉花种子:适用于Gossypiumhirsutum材料,检测纤维发育期干旱诱导基因表达和纤维强度变化

6.向日葵种子:针对Helianthusannuus样本,侧重油分积累胁迫响应基因谱及油脂成分关联

7.马铃薯块茎:涵盖Solanumtuberosum组织,检测模拟干旱贮藏基因表达变化与发芽抑制率

8.番茄种子:包括Solanumlycopersicum品种,重点分析果实发育期胁迫基因表达与品质参数

9.油菜种子:针对Brassicanapus材料,检测油脂合成途径干旱影响及基因表达相关性

10.高粱种子:覆盖Sorghumbicolor品系,侧重耐旱品种筛选基因表达谱及生理指标验证

检测方法

国际标准:

  • ISO20387:2018生物样本质量控制要求
  • MIQE指南:实时荧光定量PCR实验规范
  • ENISO17025:2017检测实验室能力通用标准
国家标准:
  • GB/T30984-2014植物逆境生理生化检测方法
  • NY/T标准系列:农作物胁迫响应测试规程
  • GB/T5009系列:食品及相关产品安全检测
(国际标准强调数据可重现性和置信区间计算,国家标准更注重本土作物特异性测试和重复性验证)

检测设备

1.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000型(通量最高20Tb,读长2x150bp)

2.实时荧光定量PCR仪:Bio-RadCFX96Touch型(灵敏度0.01ng/μl,温度精度±0.1°C)

3.激光共聚焦显微镜:LeicaTCSSP8型(分辨率0.2μm,激光波长405-785nm)

4.液相色谱-质谱联用仪:Agilent1290InfinityII/6545Q-TOF型(质量精度1ppm,流速范围0.1-5ml/min)

5.超速离心机:BeckmanCoulterOptimaXPN-100型(最大转速100,000rpm,温控±0.5°C)

6.电泳系统:Bio-RadMini-PROTEANTetra型(电压范围50-500V,凝胶尺寸8x10cm)

7.酶标仪:ThermoScientificMultiskanSkyHigh型(波长范围200-1000nm,检测速度5秒/孔)

8.气候模拟箱:ConvironBDW160型(温控精度±0.5°C,湿度范围30-95%)

9.土壤水分传感器:DecagonDevicesGS3型(精度±3%VWC,测量范围0-100%)

10.冷冻干燥机:LabconcoFreeZone2.5L型(冷冻温度-50°C,真空度<100mTorr)

11.纳米滴分光光度计:ThermoNanoDropOne型(样品量1μl,波长范围190-850nm)

12.凝胶成像系统:SyngeneG:BOXChemiXX9型(像素500万,动态范围4.8OD)

13.生物反应器:Applikonez-Control型(容量5L,搅拌速度50-1200rpm)

14.自动液体处理工作站:HamiltonMicrolabSTAR型(精度±1μl,通量96孔板)

15.细胞粉碎仪:BertinPrecellys24型(最大转速6500rpm,样品容量24x2ml)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

本文链接:https://www.yjser.com/huanjingjiance/23761.html

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